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Société Nationale Française de Gastro-Entérologie Envoyer à un ami Imprimer

Profil d'expression génique différentiel entre cancer du pancréas et pancréatite chronique: résultats d'une étude clinique prospective multicentrique à partir du matériel de cytoponction pancréatique
B. Bournet, M. Bouisson, P. Senesse, M. Barthet, N. Lesavre, D. O'Toole, A. Aubert, P. Hammel, P. Levy, P. Ruszniewski, P. Cordelier, J. Escourrrou, L. Buscail

 Introduction

Le diagnostic différentiel entre cancer du pancréas et pancréatite chronique (notamment dans sa forme pseudotumorale) demeure problématique en pratique clinique courante. A partir des différentes études sur puce à ADN (macroarrays, incluant notre expérience) certains gènes ont été isolés comme pouvant être spécifiques de l'adénocarcinome pancréatique humain ou de la pancréatite chronique. Le but de cette étude était de tester ces gènes candidats en situation clinique et de façon multicentrique sur matériel de cytoponction pancréatique prélevé sous échoendoscopie.
 

 Patients et Méthodes

Du matériel de cytoponction pancréatique a été prospectivement prélevé sous échoendoscopie chez 119 patients porteurs d'une masse solide (H : 70, F : 49, âge moyen 65 ans, extrêmes : 31 - 88 ans) à partir de 4 centres français où le suivi clinique a été effectué jusqu'au diagnostic final. Une fraction du matériel cytologique a été conservée dans le RNAlater avant extraction de l'ARN (RNAeasy Qiagen), vérification (Agilent Bioanalyzer 2100) et amplification en cDNA. Les échantillons étaient ensuite déposés sur plaques microfluidiques (Taqman low density arrays) permettant la détection de 23 gènes candidats (en doublets) et de gènes de ménage. Les résultats étaient exprimés en différence de cycle d'amplification (Ct) corrigés par l'expression du gène de ménage 18S (DeltaCt). Des préparations d'ARN non dégradées et amplifiables ont été obtenues chez 60 patients (50%) avec parmi eux : un adénocarcinome prouvé par la ponction biopsie initiale (n = 29), un adénocarcinome prouvé par une biopsie ultérieure ou par un autre voie d'abord (scanner ou biopsie d'un autre site comme une métastase) après une première biopsie négative (n = 8), une pancréatite chronique pseudotumorale (n = 10) une autre tumeur pancréatique (n = 7), ou pas de diagnostic avec suivi clinique ultérieur nécessaire (n = 6).
 

 Résultats

L'analyse comparative des profils d'expression génique entre les groupes fait apparaître un profil différentiel d'expression génique entre adénocarcinome et pancréatite chronique (différence significative après t-tests, tests non paramétriques, tests de variance) : en effet une variation significative (augmentation pour la plupart) des gènes Krt7, Krt17, Msln, Lcn2, mmp11, mmp7, Plau, S100p, Sfn et TIMP2 est mesurée dans l'adénocarcinome par rapport à la pancréatite chronique. De plus ce profil d'expression génique est similaire chez les patients avec une biopsie initiale négative mais un diagnostic ultérieur prouvé de cancer. Par contre le profil génique est totalement différent dans les autres types de tumeurs pancréatiques par rapport au cancer et à la pancréatite chronique.
 

 Conclusion

Nous avons mis en évidence pour la première fois, dans des conditions cliniques, et de façon multicentrique un profil d'expression génique différentiel entre adénocarcinome pancréatique et pancréatite chronique. Le transfert à la clinique passe par l'augmentation de matériel prélevé pour doubler le rendement d'extraction d'ARN. L'analyse par PCR quantitative des ces gènes sélectionnés pourront aider au diagnostic difficile des pancréatopathies chroniques.
 

 Mots-clés :
Noyau, Expression Des Gènes, Transfert Des Gènes
Pancréatites Chroniques
Pancréas Exocrine

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